1978 年初，在时任全国人大常委会副委员长廖承志同志的亲切关怀和倡议下，国务院根据国家侨务工作的需要和海外侨胞的要求，作出复办暨南大学并创办暨南大学医学院的决定。由此，暨南大学医学院作为我国第一所面向海外、面向港澳台地区招生的综合性大学医学院在广州建立。医学院建院之初，在全国选调师资，将原华西医科大学口腔颌面外科学专家吕培锟教授调入暨南大学负责筹建口腔医学系。1982年口腔医学专业正式招生，学制为六年。按照暨南大学“面向港澳、面向海外”的办学方针，本科课程设置与香港及美国牙科医学院系接轨。2004年，口腔医学专业学制调整为5年，与国内院校一致。1998年口腔医学专业获批口腔临床医学硕士学位点，2000年成为首批口腔医学专业硕士学位授予点，2012年获批口腔医学一级学科硕士学位点。2016年7月，学校重组医学院为医学部，口腔医学院正式成立。2017年口腔医学专业成为我校国家“双一流”建设学科的重要组成部分。同年口腔医学院与广东省顺德区人民政府签订合作协议，利用“政府办，大学管”的改革体制，共建暨南大学附属口腔医院。口腔医学专业先后入选2020年省级一流本科专业建设点、2021年国家级一流本科专业建设点。2021年口腔医学实验中心获批省级实验教学示范中心。

根据党和国家统战工作大局和学校的总体布局、服务国家和地方经济社会发展、引领国家华侨高等教育发展的使命，口腔医学院立足广东，扎根大湾区，面向海内外，坚持立德树人和侨校特色育人模式，以培养有家国情怀的国际化的符合岗位胜任力的口腔医学人才为使命，探索构建具有暨南口腔特色的教育体系，着力培养适应新时代高质量发展的口腔专业人才，把学院打造成粤港澳大湾区特别是港澳台地区口腔医学人才培养的重要基地。

口腔医学院的办学恪守“忠信笃敬”之校训，坚持“侨校+名校”的发展战略，秉持“质量是生命，创新是灵魂”的办学理念，确立了立德树人、夯实基础、突出创新、全面发展的育人观，坚持适度规模、注重内涵和国际化办学的发展观，在长期的实践中逐步形成“更卓越、更国际、更美好”的暨南口腔办学特色。